19199年，地球遭到外星人和伽美拉斯帝國(guó)的入侵。Gamelas在冥王星上建立了一個(gè)正面基地，并對(duì)地球進(jìn)行了不分青紅皂白的攻擊。海水蒸發(fā)，地球變成紅棕色，地球上的生物死于放射性污染。人類建造了地下城市，形成了地球防御力量，抵抗仍在繼續(xù)，在科學(xué)力量出現(xiàn)之前沒有任何技術(shù)，放射性污染在地下發(fā)展，在大約一年的時(shí)間里，人類瀕臨滅絕。最后一支地球防御艦隊(duì)在冥王星空域與伽美拉斯太空艦隊(duì)的戰(zhàn)斗中崩潰，人類生存的希望似乎被徹底粉碎。然而，其中一艘在海戰(zhàn)期間從外太空飛行的航天器將被運(yùn)送到火星。其中，伊斯坎達(dá)爾發(fā)出了一條救濟(jì)信息，“來(lái)接收放射性去除裝置，宇宙清潔劑D”和航行所需的波浪發(fā)動(dòng)機(jī)的設(shè)計(jì)。波浪引擎安裝在大和號(hào)上，大和號(hào)在最秘密的情況下被改造成了太空戰(zhàn)艦，目的從地球逃生變成了接收放射性去除裝置和宇宙清潔劑D。太空戰(zhàn)艦大和號(hào)如果在1年內(nèi)不返回148000光年以外的大麥哲倫云的伊卡納爾星，將在人類毀滅的情況下給人類帶來(lái)最后的希望。大和與伽美拉斯帝國(guó)作戰(zhàn)，在未知空間克服障礙的同時(shí)瞄準(zhǔn)了這顆島國(guó)之星。