公元2220年，曾被用來保護地球和人類的大和號在寶瓶座海域休眠了17年。在經歷了長期的和平之后，地球正面臨著最大的危機。一個代號為“小瀑布”的黑洞正以極快的速度接近太陽系，人類賴以生存的藍色星球即將消失。為了找到一線希望，人類開始實施大規(guī)模的移民計劃，在運輸船的幫助下，人們分批移民到瑟蘭系統(tǒng)的阿瑪爾。然而，在這個過程中，運輸船在星際聯(lián)盟中被外星生命視為侵略者，遭受了毀滅性的打擊。古晉的妻子阿雪也在最近的一次護送行動中失蹤。距離地球毀滅還有不到一個月的時間，顧進被任命為第三移民護航艦隊的總司令，全新的大和號也在這次移民中復活了。。。本片改編自松本零的同名原作。
